三文鱼细菌不多。正常健康的三文鱼不带细菌，但三文鱼切开之后很容易被外部细菌污染。为了避免污染三文鱼，其加工环境需要进行特别消毒，并且运输全程需要冷链保存，以此减少细菌的繁殖。除此之外，三文鱼寄生虫问题比较严重，最好不要生吃。
三文鱼又名大马哈鱼、鲑鱼、撒蒙鱼，主要分布在大西洋与太平洋、北冰洋交界的水域，属于冷水性的高度洄游鱼类，被国际美食界誉为“冰海之皇”。研究表明，金枪鱼和三文鱼均肉质鲜美，营养丰富，并且富含EPA和DHA等生物活性物质。
三文鱼具有商业价值的品种有30多个，目前最常见的是三文鳟、金鳟这两种鳟鱼和太平洋鲑、大西洋鲑、北极白点鲑、银鲑这四种鲑鱼。三文鱼的主要生产国有日本、俄罗斯、美国和加拿大。烹饪三文鱼有很多种方法，其中熏制或腌制鲑鱼能完好保留其营养成分。
三文鱼的寄生虫比较多，以异尖线虫最常见，容易引起腹痛腹泻，不过海水寄生虫无法在人体内长期生存。相比而言，养殖三文鱼的寄生虫可能会少一些。值得注意的是，淡水养殖的虹鳟鱼有时也会被用来做刺身，但它的风险远远大于三文鱼。
这是因为淡水鱼中的寄生虫可以在人体内生存，其中最常见的是肝吸虫。因此，淡水养殖的虹鳟鱼不能生食。异尖线虫可以通过在零下20℃冷冻超过24小时或在零下35℃冷冻15小时的方法来将其冻死。
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